La diferencia clave entre epistasis y pleiotropía es que la epistasis es el fenómeno en el que un gen en un locus altera la expresión fenotípica de un gen en otro locus, mientras que la pleiotropía explica el fenómeno en el que un solo gen afecta múltiples rasgos fenotípicos …
La epistasis y la pleiotropía son dos fenómenos en genética. La epistasis ocurre cuando más de un gen determina un solo fenotipo. Por tanto, en la epistasis, un gen influye en la expresión de otro gen ubicado en un locus diferente. Por el contrario, la pleiotropía ocurre cuando un gen determina múltiples fenotipos. Por tanto, un gen contribuye a múltiples características. Tanto la epistasis como la pleiotropía son variaciones de la herencia mendeliana.