La diferencia clave entre la inmunidad mediada por células y la mediada por anticuerpos es que la inmunidad mediada por células destruye las partículas infecciosas mediante la lisis celular por citoquinas, sin la producción de anticuerpos, mientras que la inmunidad mediada por anticuerpos destruye los patógenos al producir anticuerpos específicos contra los antígenos.
La inmunidad mediada por células y la inmunidad mediada por anticuerpos son dos tipos de mecanismos de defensa primarios que tienen lugar en nuestro cuerpo. La inmunidad mediada por células opera contra patógenos intracelulares. Por lo tanto, actúa dentro de las células infectadas y destruye los patógenos liberando citocinas. En contraste, la inmunidad mediada por anticuerpos opera contra patógenos extracelulares al producir anticuerpos contra los antígenos presentes fuera de las células infectadas o que circulan libremente en la sangre. Además, los linfocitos B llevan a cabo principalmente inmunidad mediada por anticuerpos mientras que los linfocitos T llevan a cabo inmunidad mediada por células.