La diferencia clave entre el endotelio y el mesotelio es que el endotelio es la capa de células epiteliales escamosas simple que recubre todo el sistema circulatorio, incluidos los vasos sanguíneos, los vasos linfáticos y el corazón, mientras que el mesotelio es la capa de células epiteliales escamosas simple que recubre las principales cavidades del cuerpo, como el peritoneo, la pleura y el pericardio.
El epitelio, el mesotelio y el endotelio son tres tipos de capas celulares que recubren nuestros órganos internos, las cavidades corporales y la piel. Por tanto, todos son barreras protectoras del cuerpo. Estructuralmente, el mesotelio y el endotelio son capas epiteliales especializadas o modificadas con origen mesodérmico. En consecuencia, están formados por células epiteliales escamosas simples. Tanto el mesotelio como el endotelio son tejidos de una sola capa. Forran ciertas superficies internas.