La diferencia clave entre la fotosíntesis y la fotorrespiración es que la fotosíntesis es el proceso mediante el cual los fotoautótrofos, principalmente plantas verdes, algas y cianobacterias, generan carbohidratos y oxígeno a partir del dióxido de carbono y el agua utilizando la energía de la luz solar, mientras que la fotorrespiración es una reacción secundaria en la que la enzima RuBisCO oxigena RuBP, lo que hace que se desperdicie parte de la energía producida por la fotosíntesis.
La fotosíntesis y la fotorrespiración son dos procesos que ocurren en las plantas. Sin embargo, la fotosíntesis es un proceso importante, mientras que la fotorrespiración es un proceso inútil. Parte de la energía y el carbono fijo se desperdician por la fotorrespiración de la enzima llamada RuBP oxigenasa-carboxilasa. Por lo tanto, la fotorrespiración se puede denominar un proceso que reduce la eficiencia de la fotosíntesis en las plantas.
