Diferencia clave: proteómica frente a transcriptómica
La tecnología ómica es una tendencia actual, donde las diferentes biomoléculas de un organismo son consideradas como una colección completa en cuanto a sus propiedades y funciones. La tecnología ómica tiene una amplia gama de aplicaciones. Las diferentes ómicas de una muestra biológica incluyen genómica, proteómica, transcriptómica y metabolómica. La proteómica implica el estudio completo de todas las proteínas de un organismo vivo. Se define como el conjunto de todas las proteínas expresadas en un organismo, sus propiedades estructurales y funcionales. El conjunto completo de proteínas, por lo tanto, forma el proteoma. La transcriptómica es el estudio completo de todas las moléculas de ARN mensajero (ARNm) presentes en un organismo vivo. Por tanto, la transcriptómica se ocupa de los genes que se expresan activamente en un organismo vivo. El conjunto total de ARNm en un organismo vivo se conoce como transcriptoma. La diferencia clave entre proteómica y transcriptómica se basa en el tipo de biomolécula. En proteómica, se estudia el conjunto total de proteínas expresadas en un organismo vivo mientras que, en transcriptómica, se estudia el ARNm total de un organismo vivo.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia clave
2. Qué es la proteómica
3. Qué es la transcriptómica
4. Similitudes entre la proteómica y la transcriptómica
5. Comparación lado a lado: proteómica frente a transcriptómica en forma tabular
6. Resumen
¿Qué es la proteómica?
El término proteómica se acuñó en el año 1995 y se definió inicialmente como el complemento proteico total en una célula, tejido u organismo. Con el avance de los estudios proteómicos, se modificó para ser considerado como un término general en el que se incluyeron muchos campos de estudio. Actualmente, bajo el tema proteómica se estudia la estructura, orientación, funciones, sus interacciones, sus modificaciones, sus aplicaciones y la importancia de las proteínas. Por lo tanto, en la actualidad se realizan muchas investigaciones en el campo de la proteómica.
Se realizaron los primeros estudios proteómicos para identificar el contenido de proteínas en Escherichia coli. El mapeo del contenido de proteína total se realizó utilizando geles bidimensionales (2D). Tras el éxito de esto, los científicos pasaron a caracterizar el contenido total de proteínas en animales como conejillos de indias y ratones. En la actualidad, el mapeo de proteínas humanas se realiza mediante electroforesis en gel 2D.
Aplicaciones de la proteómica
El estudio de la proteómica tiene muchas ventajas, ya que las proteínas son las moléculas gobernantes de la mayor parte de la actividad debido a la propiedad catalizadora de las proteínas. Por tanto, el estudio de proteínas completas puede aportar información sobre el estado de salud de un organismo. Algunas aplicaciones son;
- Anotación del genoma: mediante el estudio del contenido de proteínas de un organismo, se pueden determinar los genomas exactos responsables del compuesto proteico activo. En este escenario los resultados de toda la genómica, la transcriptómica y la proteómica son importantes.
- Identificación / diagnóstico de enfermedades: la proteómica se utiliza en la identificación de la condición de la enfermedad, comparando los sanos y los enfermos.
- Realizar la expresión de proteínas estudiadas durante la experimentación.
- Estudios de modificaciones e interacciones de proteínas: Para utilizar proteínas en condiciones in vitro o in vivo, decidir las condiciones de almacenamiento de estas proteínas extraídas y estudiar el comportamiento de la proteína en métodos in vitro, in vivo e in silico.
Figura 01: Proteómica
Existen diferentes técnicas involucradas en proteómica
- Extracción de la proteína total y separación de las proteínas mediante electroforesis en gel 2D. Las proteínas también se pueden separar mediante cromatografía líquida de alta resolución (HPLC).
- Secuenciación de las proteínas extraídas mediante métodos como el método de secuenciación de Edmund o la espectrometría de masas.
- Una vez identificadas las secuencias, se analizan las propiedades estructurales y funcionales del contenido proteico utilizando software informático y herramientas bioinformáticas.
¿Qué es la transcriptómica?
El término transcriptoma se acuñó recientemente. La Transcriptómica es el estudio del contenido total de ARNm de un organismo. El ARNm total es el ADN expresado en un organismo vivo o una célula. La colección completa de ARNm se conoce como transcriptoma.
Los pasos para analizar el transcriptoma incluyen,
- Extracción de ARN, separación de ARNm mediante cromatografía en columna de gel con perlas de poli DT.
- Se realiza la secuenciación del ARNm.
La tecnología de microarrays es una forma común de identificar el transcriptoma de un organismo. La técnica de microarrays implica una placa de sonda con las hebras complementarias del transcriptoma. Tras la hibridación, se puede caracterizar el ARNm presente en el organismo o las células.
Figura 02: Técnicas transcriptómicas
La transcriptómica ahora se usa ampliamente en el campo médico. El diagnóstico de enfermedades y la elaboración de perfiles de enfermedades son los campos principales en los que se utiliza la transcriptómica. Al analizar un transcriptoma de un organismo, se puede identificar el ARNm extraño y, si hay alguna infección, se puede identificar. El ARN no codificante se puede separar mediante tecnologías transcriptómicas. Y también se puede monitorear la expresión de genes bajo diferentes tensiones ambientales.
¿Cuáles son las similitudes entre la proteómica y la transcriptómica?
- Ambos forman parte del concepto de tecnología ómica.
- Ambos se utilizan en el diagnóstico de enfermedades y en la caracterización de enfermedades de un organismo.
- Ambas áreas de estudio involucraron la extracción de la biomolécula, la separación de la biomolécula y los pasos de secuenciación.
¿Cuál es la diferencia entre proteómica y transcriptómica?
Diferencia del medio del artículo antes de la mesa
Protemica vs transcriptómica |
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| La proteómica implica el estudio completo de todas las proteínas de un organismo vivo. | La transcriptómica es el estudio completo de todas las moléculas de ARN mensajero (ARNm) presentes en un organismo vivo. |
| Tipo de molécula biológica estudiada | |
| Las proteínas se estudian en proteómica. | Los ARNm se estudian en transcriptómica. |
| Factores estudiados | |
| La estructura, función, interacciones, modificaciones y aplicaciones de las proteínas se estudian en proteómica. | La estructura de la secuencia, las interacciones con el medio ambiente y las aplicaciones del ARNm se estudian en transcriptómica. |
Resumen: proteómica vs transcriptómica
La ómica juega un papel importante en el campo de las ciencias de la vida. La proteómica se refiere al estudio del proteoma que forma las colecciones completas de proteínas en una célula u organismo. La transcriptómica se refiere al estudio del transcriptoma, que es el conjunto completo de ADN expresado que está en forma de ARNm. Las dos áreas de estudio, proteómica y transcriptómica, se derivaron después de la introducción de la genómica y actualmente se utilizan ampliamente en diagnósticos médicos y en la caracterización y detección de organismos. Esta es la diferencia entre proteómica y transcriptómica …
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