La diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica que se utiliza para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular contando el número de interacciones intermoleculares favorables.
Los términos anclaje molecular y puntuación se utilizan en el campo del modelado molecular. El modelado molecular es una técnica que se utiliza para determinar las posibles disposiciones de diferentes moléculas en una sustancia determinada. Esta técnica es importante para crear nuevos compuestos estables.