La diferencia clave entre el antígeno O y H es que el antígeno O es la parte más externa de la superficie que cubre la bacteria, mientras que el antígeno H es la estructura delgada filiforme que forma parte de los flagelos.
Los antígenos son sitios de reconocimiento molecular presentes en muchas bacterias, hongos, virus, partículas de polvo y otras partículas celulares y no celulares que podrían ser reconocidas por el sistema inmunológico del huésped. Generalmente, la mayoría de los antígenos están presentes en la superficie celular. Estructuralmente, los antígenos pueden ser proteínas, aminoácidos, lípidos, glicolípidos o glicoproteínas o marcadores de ácidos nucleicos. Estas moléculas poseen una capacidad específica para provocar una respuesta inmune en el huésped. Esta respuesta inmune se produce al desencadenar la producción de anticuerpos como resultado correspondiente.
Los antígenos se utilizan generalmente en el sistema de identificación de serotipos de las bacterias. Salmonella es un género bacteriano que tiene muchos serotipos. Los serotipos son grupos de microorganismos dentro de la misma especie. Estos serotipos se pueden distinguir utilizando la combinación de antígeno O y antígeno H. El antígeno O es una cadena lateral de LPS, mientras que el antígeno H es parte de los flagelos.
