La diferencia clave entre Prototheria Metatheria y Eutheria es que Prototheria se refiere a mamíferos que ponen huevos, mientras que Metatheria se refiere a marsupiales que dan a luz a crías parcialmente desarrolladas, y Eutheria se refiere a mamíferos placentarios que dan a luz a crías bien desarrolladas.
Con base en las principales variaciones en los sistemas reproductivos, los mamíferos se pueden clasificar en tres subclases: Prototheria, Metatheria y Eutheria. La prototeria incluye a los mamíferos más primitivos, que son mamíferos que ponen huevos, especialmente los monotremas. Metatheria incluye marsupiales, mientras que Eutheria incluye verdaderos mamíferos placentarios. De hecho, Eutheria es la subclase más grande de mamíferos.