La diferencia clave entre los receptores AMPA y NMDA es que el agonista específico del receptor AMPA es el ácido alfa-amino - 3 - hidroxil - 5 - metil - 4 - isoxazol propiónico (AMPA), mientras que el agonista específico del receptor NMDA es N - metil - D - aspartato (NMDA).
Hay tres tipos principales de receptores de glutamato. Su diferencia se basa en el agonista que se une para la activación del receptor para la unión del glutamato. La unión del glutamato abrirá los canales abiertos por iones para el transporte de iones de sodio y potasio. Además, los receptores NMDA también facilitan el flujo de iones calcio a través de la membrana.