La diferencia clave entre las raíces parásitas y las micorrizas es que las raíces parásitas son las raíces de las plantas parásitas no fotosintéticas, mientras que las micorrizas son un tipo de asociación mutualista que existe entre las raíces de una planta superior fotosintética y un hongo.
El parasitismo y el mutualismo son dos asociaciones simbióticas que existen entre dos especies diferentes que conviven. El parasitismo es beneficioso solo para el parásito, ya que el parásito obtiene alimentos y otros requisitos del huésped mientras lo daña. Por otro lado, el mutualismo beneficia a ambos socios que están en la asociación. Las micorrizas son un tipo de asociación mutualista que ocurre entre una planta superior y un hongo. El hongo vive en las raíces de las plantas superiores. Las plantas superiores proporcionan alimentos al hongo, mientras que el hongo absorbe el agua y los nutrientes del suelo a la planta.