La diferencia clave entre el aislamiento geográfico y reproductivo es que el aislamiento geográfico es una categoría de aislamiento reproductivo que se refiere a la separación de poblaciones de organismos para que no se apareen o intercambien su material genético por límites físicos, mientras que el aislamiento reproductivo se refiere a un conjunto de mecanismos que previenen las especies. de aparearse y producir descendencia fértil.
La fertilización es la unión de un espermatozoide y un óvulo para formar un cigoto diploide durante la reproducción sexual. Si el cigoto producido está maduro, eventualmente se convertirá en una descendencia fértil y saludable. por tanto, el aislamiento reproductivo es un proceso que evita la formación de una descendencia fértil. Esta prevención puede ocurrir durante el proceso de fertilización o después de la fertilización. De todos modos, al final, crea una barrera para producir una descendencia fértil que puede dar a luz a otra descendencia fértil. Entre los diferentes mecanismos, el aislamiento geográfico es un factor de aislamiento reproductivo.