Diferencia clave: transposasas bacterianas frente a integrasas retrovirales
El material genético transportable ha evolucionado con dos estrategias principales para pasar de una región a la siguiente región dentro y entre los genomas. Un método consiste en desplazar a través de una molécula de ARN antes de la formación de una molécula de ADN, mientras que la otra vía involucra intermedios de ADN. Las transposasas y las integrasas virales son ejemplos de dicho material genético transponible. Las transposasas bacterianas se unen al final de los transposones y facilitan la catálisis del movimiento del transposón a otra parte del genoma a través de varios mecanismos. Las integrasas retrovirales son enzimas que ayudan en la integración del material genético de retrovirus como el VIH en el material genético (ADN) de la célula huésped que infecta. Esta es la diferencia clave entre las transposasas bacterianas y las integrasas retrovirales …
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia clave
2. Qué son las transposasas bacterianas
3. Qué son las integrasas retrovirales
4. Similitudes entre las transposasas bacterianas y las integrasas retrovirales
5. Comparación lado a lado - Transposasas bacterianas versus integrasas retrovirales en forma tabular
6. Resumen
¿Qué son las transposasas bacterianas?
La transposasa se puede definir como una enzima unida al final de los transposones que facilitan la catálisis del movimiento del transposón a otra parte del genoma a través de varios mecanismos. Dichos mecanismos incluyen el "mecanismo de cortar y pegar" y el "mecanismo de transposición replicativa". La transposasa se introdujo por primera vez mediante la clonación de la enzima que se necesita para la transposición del transposón Tn3. Los elementos genéticos transponibles han utilizado dos estrategias importantes para el desplazamiento entre genomas o de un sitio a otro. El transporte a través de un intermedio de ARN antes de la síntesis de una copia de ADN es una estrategia, mientras que la otra se une a los intermedios de ADN solo. Las reacciones de recombinación que intervienen en la integración de ambos elementos se producen debido a enzimas específicas de los elementos. Así,en un caso de elementos de ADN, estas enzimas se conocen como transposasas, mientras que en un caso de elementos de ARN, se conocen como integrasas.
Al comparar las diferencias entre ambas estrategias de transposición, el proceso de inserción parece ser químicamente idéntico. Pero, evidencia reciente propone que ciertas similitudes en el mecanismo de integración se ven en las regiones de secuencias de aminoácidos que forman un sitio activo; el motivo DDE. Actualmente se están clasificando cinco familias de transposasas, pero el número de familias aún no ha aumentado con nuevos caracteres de transposasas. Las familias incluyen DDE transposasa, tirosina (Y) transposasa, serina (S) transposasa, transposasa de círculo rodante, transcriptasas / endonucleasas inversas (RT / En), etc. Estas familias utilizan mecanismos catalíticos únicos para la ruptura y la unión del ADN. La transposasa DDE participa en el mecanismo de cortar y pegar del transposón original y lleva tres conjuntos de aminoácidos conservados, a saber;aspartato (D), aspartato (D) y glutamato (E). Las tirosina transposasas también participan en el mecanismo de cortar y pegar mediante la utilización de residuos de tirosina, que es específico del sitio.
Figura 01: Transposasas bacterianas
Las transposasas de serina involucran un intermedio de ADN circular y llevan a cabo el mecanismo de cortar y pegar al igual que las familias anteriores. La transposasa del círculo rodante participa en el mecanismo de copia en el que una sola hebra se copia directamente en el sitio objetivo a través de la replicación del ADN. Esto asegura que la hebra molde y la hebra copiada tengan una hebra que se sintetice nuevamente. La transposasa de transcriptasas / endonucleasas inversas tiene varios mecanismos de transposición.
¿Qué son las integrasas retrovirales?
En el contexto de la Integrasa Retroviral, se considera como una enzima retroviral que ayuda en la integración del material genético de retrovirus como el VIH en el material genético (ADN) de la célula que está infectada. Estas integrasas retrovirales se confunden con mayor frecuencia con integrasas de fagos. Los ejemplos de integrasa de fagos son la integrasa de fagos λ. Pero estas son enzimas completamente diferentes y no deben confundirse con ellas. Con respecto a la formación del complejo de preintegración retroviral, la integrasa retroviral juega un papel importante. Las proteínas de la integrasa retrovírica normalmente constan de tres (03) dominios canónicos. Estos dominios están conectados por enlaces flexibles.
Los tres dominios incluyen un dominio de unión al zinc N terminal donde tres haces helicoidales están conectados y estabilizados mediante la coordinación con la participación de un Zn 2+catión, un dominio de núcleo catalítico de pliegue de RNasa H y un dominio de unión de ADN C terminal, que es un pliegue de SH3. Mediante investigación y mediante información bioquímica y estructural, sugiere que la integrasa retroviral tiene la capacidad de funcionar como un dímero de dímeros (tetrámero). En el contexto de la multimerización y la unión del ADN viral, los tres dominios de la proteína integrasa retroviral. La función principal de la integrasa retroviral es insertar su material genético en el ADN del huésped. Este paso es el paso más crucial en la replicación viral del virus del VIH. Una vez integrado con éxito, permanecerá en el ADN cromosómico de la célula durante el resto de su vida útil.
Figura 02: Integras retrovirales
Por tanto, una vez integrado no hay retorno para el celular. Estas integrasas retrovirales implican la catalización de dos reacciones principales que incluyen el procesamiento del extremo 3 'y la ligadura covalente. Durante el procesamiento del extremo 3 ', se eliminan 2-3 nucleótidos de ambos extremos 3' del ADN viral con la intención de revelar los dinucleótidos CA de los extremos 3 'del ADN viral, y durante la ligadura covalente, los extremos 3' procesados de El ADN viral se liga covalentemente al ADN cromosómico del hospedador.
¿Cuál es la similitud entre las transposasas bacterianas y las integrasas retrovirales?
Tanto las transposasas bacterianas como las integrasas retrovirales tienen secuencias de aminoácidos similares
¿Cuál es la diferencia entre las transposasas bacterianas y las integrasas retrovirales?
Diferencia del medio del artículo antes de la mesa
Transposasas bacterianas frente a integrasas retrovirales |
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| La transposasa bacteriana es una enzima unida al final de los transposones al tiempo que facilita la catálisis del movimiento del transposón a otra parte del genoma a través de varios mecanismos. | Las integrasas retrovirales se consideran una enzima retroviral que ayuda en la integración del material genético de retrovirus como el VIH en el material genético (ADN) de la célula que está infectada. |
| Regiones vinculantes | |
| Se necesitan regiones de unión altamente específicas para las transposasas bacterianas. | Se necesita menos o ninguna secuencia de nucleótidos para la unión. |
Resumen: transposasas bacterianas frente a integrasas retrovirales
Las transposasas bacterianas se consideran una enzima retroviral que ayuda a la integración del material genético de retrovirus como el VIH en el material genético (ADN) de la célula que está infectada. Los elementos genéticos transponibles han utilizado dos estrategias importantes para el desplazamiento entre genomas o de un sitio a otro. Actualmente se están clasificando cinco familias de transposasas, pero el número de familias aún no ha aumentado con nuevos caracteres de transposasas. Integrasa retroviral, se considera como una enzima retroviral que ayuda en la integración del material genético de retrovirus como el VIH en el material genético (ADN) de la célula infectada. Las proteínas de la integrasa retrovírica normalmente constan de tres (03) dominios canónicos. La función principal de la integrasa retroviral es insertar su material genético en el ADN del huésped. Este paso es el paso más crucial en la replicación viral del virus del VIH. Por tanto, una vez integrado no hay retorno para el celular. Ésta es la diferencia entre las transposasas bacterianas y la integrasa retroviral.
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