La diferencia clave entre el cebador y el promotor es que el cebador es una secuencia de ADN corta sintetizada comercialmente que se usa en la PCR para la amplificación de una secuencia de ADN diana, mientras que el promotor es una secuencia de ADN específica que proporciona un sitio de unión inicial seguro para la ARN polimerasa y los factores de transcripción en para iniciar la transcripción.
El cebador y el promotor son dos tipos de secuencias de ADN. El cebador es un pequeño fragmento de ADN necesario para la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Tiene secuencias de nucleótidos cortas complementarias al extremo flanqueante de la cadena de ADN. Hay dos tipos de cebadores y funcionan como puntos de partida para la síntesis de nuevas cadenas de ADN. Por el contrario, un promotor es una secuencia de ADN específica ubicada corriente arriba del sitio de inicio de la transcripción de un gen. Interactúa directamente con los componentes del mecanismo de transcripción como la ARN polimerasa y los factores de transcripción para controlar la transcripción del ADN. Por tanto, la ARN polimerasa y otros factores de transcripción se unen a la secuencia promotora e inician la transcripción.
