La diferencia clave entre Myxomycota y eumycota es que Myxomycota consiste en mohos de limo similares a hongos que carecen de paredes celulares en el estado vegetativo, mientras que eumycota consiste en hongos verdaderos que son microorganismos heterotróficos eucariotas filamentosos que consisten en paredes celulares rígidas.
Myxomycota y eumycota son dos divisiones principales de organismos. Myxomycota pertenece al Reino Protista, mientras que eumycota pertenece al Reino Fungi. Myxomycota comprende organismos parecidos a hongos. Carecen de paredes celulares compuestas por quitina en estado vegetativo. Pero eumycota son verdaderos hongos que tienen paredes celulares de quitina. Los verdaderos hongos tienen micelios y son microorganismos aeróbicos heterótrofos.