La diferencia clave entre la inactivación de X y la impronta genómica es que la inactivación de X es el proceso por el cual una copia del cromosoma X se inactiva en algunas mujeres, mientras que la impronta genómica es un proceso que depende del padre de origen y es el proceso en el que las copias de los genes se expresan diferencialmente.
La inactivación de X y la impronta genómica son dos procesos que pueden conducir a la expresión monoalélica. En palabras simples, ambos fenómenos provocan la desactivación de una copia de un gen. La impronta genómica tiene lugar en genes específicos, mientras que la inactivación de X provoca la inactivación de genes en todo el cromosoma X. Sin embargo, ambos procesos dan como resultado una disminución de la expresión génica.
