La diferencia clave entre las ubiquinonas y los citocromos es que las ubiquinonas (CoQ) no son proteínas, mientras que los citocromos son proteínas.
La cadena de transporte de electrones es la etapa final de la respiración aeróbica. Por tanto, ocurre en la membrana interna de las mitocondrias. Además, consta de portadores de electrones que facilitan la producción de un gradiente de protones a través de la membrana. Además de NAD y flavoproteínas, las ubiquinonas y los citocromos son dos tipos de portadores de electrones involucrados en la cadena de transporte de electrones. Las ubiquinonas son moléculas orgánicas hidrófobas, no solubles en lípidos, mientras que los citocromos son proteínas que contienen hierro.
