La diferencia clave entre el amoníaco y el amonio es que el amoníaco es una molécula polar sin carga que existe como gas a temperatura ambiente, mientras que los iones de amonio están cargados y existen como iones libres en solución o como compuestos de sal cristalizada.
Hay pocas imágenes e incluso ciertos olores que nuestra mente asocia inmediatamente con amoníaco o amonio; estos incluyen los de fertilizantes, desechos nitrogenados, jabones e incluso explosivos. Además, la mayoría de la gente asume que no hay diferencia entre el amoníaco y el amonio. La gran similitud entre estos dos, y el uso de la palabra amoníaco con mayor frecuencia como término general tanto para el amoníaco puro como para los compuestos de amonio es lo que provoca esta confusión.