La diferencia clave entre el cariotipo y el idiograma es que el cariotipo es la imagen real de los cromosomas totales de una célula, mientras que el idiograma es un diagrama esquemático de un cariotipo que ilustra todos los mapas de cromosomas.
Un conjunto de cromosomas representa el genoma y la información genética de un organismo. Cada cromosoma tiene una forma, un tamaño y un conjunto de genes únicos. El número y las estructuras físicas de los cromosomas revelan información importante sobre el organismo. El cariotipo es una técnica que se realiza para examinar el conjunto completo de cromosomas en una célula. Los cromosomas totales se recolectan y analizan durante esta prueba para determinar si existen anomalías numéricas o estructurales en los cromosomas. La imagen real que muestra el total de cromosomas de una célula es el cariotipo, mientras que el diagrama esquemático del total de cromosomas de una célula es el idiograma. Ambos son importantes en los estudios citogenéticos.
