La diferencia clave entre la esterasa y la lipasa es que la esterasa es una enzima que hidroliza los ésteres de acilo de cadena corta solubles en agua, mientras que la lipasa es una enzima que hidroliza los triacilgliceroles de cadena larga insolubles en agua.
Las hidrolasas son enzimas que catalizan esencialmente la hidrólisis de compuestos orgánicos. En el campo de la digestión e hidrólisis de lípidos y grasas, hay dos tipos principales de hidrolasas implicadas. Son esterasas y lipasas. La esterasa es una enzima que cataliza la hidrólisis de compuestos éster. En comparación, la lipasa pertenece a un subconjunto de esterasa. Cataliza la hidrólisis de lípidos, especialmente durante la digestión. Las esterasas son sustancias solubles en agua, mientras que las lipasas son insolubles en agua y están muy agregadas en agua.