La diferencia clave entre la auxina y la citoquinina es que la auxina estimula la ramificación de la raíz, mientras que la citoquinina inhibe la ramificación de la raíz y la formación de la raíz lateral. Para agregar más a esto, la auxina es principalmente responsable del alargamiento de las células en el tallo y las puntas de las raíces, mientras que las citoquininas son las principales responsables de la división celular y, por lo tanto, se encuentran en áreas de crecimiento.
Las fitohormonas, también conocidas como hormonas vegetales, son sustancias químicas importantes para el crecimiento y desarrollo de las plantas. Son moléculas orgánicas y funcionan como moléculas de señalización que regulan el desarrollo de las plantas. Hay cinco tipos principales de hormonas vegetales: auxina, giberelina, citoquinina, etileno y ácido abscísico. Por lo tanto, realizan diferentes funciones solos y juntos para influir en el crecimiento de las plantas.