Diferencia clave: genotipado frente a secuenciación
La genotipificación y la secuenciación son dos técnicas que se realizan para obtener información sobre los ácidos nucleicos, principalmente el ADN de un organismo. La diferencia clave entre el genotipado y la secuenciación es que el genotipado es el proceso de determinar qué variante genética posee el individuo utilizando marcadores, mientras que la secuenciación es la determinación del orden correcto de la secuencia de nucleótidos dentro del fragmento dado de ADN.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia clave
2. Qué es el genotipado
3. Qué es la secuenciación
4. Comparación lado a lado - Genotipado frente a secuenciación
5. Resumen
¿Qué es la genotipificación?
El genotipado es la determinación de la composición genética de un individuo utilizando una secuencia de ADN y marcadores y la comparación e identificación de su herencia. El genotipado es importante en biología evolutiva, biología de poblaciones, taxonomía, ecología y genética de los organismos. Se puede realizar mediante diferentes técnicas que incluyen secuenciación de ADN, reacción en cadena de la polimerasa, polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP), detección polimórfica amplificada aleatoriamente, polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP), microarrays de ADN, etc.
La genotipificación implica la secuenciación de pequeños fragmentos particulares de secuencias de ADN y el hallazgo de la relación de la composición genética con otros individuos utilizando marcadores genéticos. Determina los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) entre los individuos o los alelos específicos. La genotipificación es aplicable a una amplia gama de organismos, incluidos los humanos. También es aplicable a microorganismos como virus, hongos, etc. y se puede utilizar para determinar sus variantes genéticas con los perfiles de referencia. En epidemiología molecular y microbiología forense, el control de patógenos, especialmente microorganismos, se realiza mediante la información obtenida a partir de la genotipificación. La genotipificación es muy importante en el análisis de pedigrí. Los humanos están genotipados para confirmar la maternidad y la paternidad. El genotipo revelará los alelos dominantes y recesivos de genes que deciden rasgos específicos.
Figura_1: Genotipado RFLP
¿Qué es la secuenciación?
La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto del nucleótido en un fragmento dado de ADN o ARN. Prácticamente toda la información necesaria para el crecimiento y desarrollo de un organismo está codificada en su genoma. La disponibilidad de técnicas para producir y separar fragmentos de ácidos nucleicos de unos pocos cientos de nucleótidos de longitud condujo al desarrollo de procedimientos para determinar la secuencia de nucleótidos exacta de un fragmento dado de ADN o ARN. Actualmente se encuentran disponibles diferentes tipos de métodos de secuenciación. Estos métodos de secuenciación, junto con las tecnologías para la construcción de librerías genómicas que representan el genoma completo de un organismo, facilitan la secuenciación de todo el genoma de ese organismo, realizando un análisis en profundidad de las estructuras génicas, funciones genéticas, ubicaciones genéticas, expresiones genéticas, mapeo de genes, regiones reguladoras de genes, etc.
Se han secuenciado y mapeado los genomas totales de muchos virus, varias bacterias, arqueobacterias, levaduras y varios otros organismos. El proyecto del genoma humano ha hecho posible secuenciar y mapear todo el genoma humano y publicar su primer borrador en 2003. Es un hito importante en el avance de la biología. Las secuencias del genoma humano ahora se utilizan en el sector médico para identificar causas genéticas de enfermedades raras, detectar el riesgo de enfermedad en los recién nacidos, identificar detalles genéticos de diferentes cánceres, desarrollar nuevas terapias y desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico, etc.
En el mundo vegetal, se han secuenciado el genoma del arroz y los genomas de Arabidopsis. El conocimiento de estas secuencias revolucionará sin duda nuestra comprensión del funcionamiento de las células y los organismos.
Figura_2: una autorradiografía de secuenciación de Sanger
¿Cuál es la diferencia entre genotipado y secuenciación?
Diferencia del medio del artículo antes de la mesa
Genotipificación vs secuenciación |
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| El genotipado es el proceso de determinar la composición genética de un individuo y verificar el grupo o la taxonomía de ese organismo. | La secuenciación es el proceso de determinar el orden preciso de los nucleótidos de un fragmento de ADN o ARN dado. |
| Técnicas | |
| RFLP, secuenciación de genes, PCR, microarrays de ADN, AFLP, etc. | Secuenciación de Sanger, secuenciación de Gilbert, pirosecuenciación, secuenciación de próxima generación, secuenciación de escopeta, etc. |
| Principales preocupaciones | |
| A esto le preocupa más si las diferencias de genotipo están dando las diferencias de fenotipo reales. | A esto le preocupa más el orden de los nucleótidos y sus diferencias y cambios con otros organismos. |
Resumen: genotipificación frente a secuenciación
El genotipado y la secuenciación son útiles para estudiar la información genética de los organismos. El genotipado es el proceso de determinar variaciones de genotipo entre individuos y encontrar sus categorías. La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto de los nucleótidos en el fragmento interesado o en la región del ADN. Ambas técnicas proporcionan información importante sobre los genes y los genomas.
