Agarosa vs poliacrilamida
La agarosa y la poliacrilamida son polímeros solubles en agua pero, entre ellos, se pueden ver muchas diferencias, comenzando por su origen. Tanto la agarosa como la poliacrilamida tienen algo en común en su capacidad para formar matrices de gel porosas. A pesar de esto, existen varias diferencias claras entre los dos. Las principales diferencias entre ambos polímeros radican en su naturaleza de origen, estructura química, sus diferentes usos y su rendimiento en términos de electroforesis en gel.
¿Qué es la agarosa?
La agarosa es un polímero lineal de origen natural que a su vez se deriva de un polímero complejo llamado agar que se encuentra en las algas. La agarosa se extrae del agar mediante la eliminación de su componente proteico llamado agaropectina. La agarosa es lo que le da al agar su capacidad para formar geles.
El uso principal de la agarosa es en estudios de biología molecular y microbiológica. En estudios microbiológicos, la agarosa, cuando se complementa con los nutrientes adecuados, proporciona una base sólida para cultivar microorganismos como bacterias y hongos. Cuando se usa en concentraciones semisólidas, puede ser útil para evaluar la motilidad de estos microorganismos. En biología molecular, sirve como una herramienta importante para uno de los procesos de resolución más fundamentales llamado 'electroforesis en gel' o 'electroforesis en gel de agarosa' (AGE). La electroforesis en gel es un proceso que permite la resolución o separación de ácidos nucleicos o proteínas en función de su tamaño y carga. Aquí, la agarosa sirve como un gel poroso similar a un tamiz a través del cual ocurre la separación.
Estructura de agarosa
¿Qué es la poliacrilamida?
La poliacrilamida es un polímero sintético y se utiliza en una amplia variedad de industrias. Como se mencionó anteriormente, su uso se basa en su capacidad para formar geles. Sin embargo, además de esto, su capacidad para retener y drenar agua en diferentes concentraciones también se explota en varias industrias.
El uso más extendido y común de la poliacrilamida es el tratamiento de aguas residuales. Aquí, se utiliza como agente floculante para eliminar cualquier material orgánico suspendido; por lo tanto, mejora la turbidez y aclara el agua. Otro uso de la poliacrilamida es en la industria del papel. Aquí, se utiliza para retener o drenar el agua de la pulpa de papel según sea necesario. Asimismo, en las industrias agrícola y de la construcción, se utiliza como acondicionador de suelos para prevenir la erosión del suelo y mejorar su calidad.
Al igual que la agarosa, la poliacrilamida también se utiliza en biología molecular como una importante herramienta de resolución en un proceso similar llamado "electroforesis en gel de poliacrilamida" (PAGE). Además de todo esto, la poliacrilamida también se utiliza en el procesamiento de minerales y la fabricación de agentes floculantes para eliminar cualquier material orgánico suspendido; por lo tanto, mejora la turbidez y aclara el agua. Otro uso de la poliacrilamida es en la industria del papel. Aquí, se utiliza para retener o drenar el agua de la pulpa de papel según sea necesario. Asimismo, en las industrias agrícola y de la construcción, se utiliza como acondicionador de suelos para prevenir la erosión del suelo y mejorar su calidad. Además de todo esto, la poliacrilamida también se utiliza en la fabricación de aditivos alimentarios, lentes de contacto blandas y textiles.
Estructura de poliacrilamida
¿Cuál es la diferencia entre agarosa y poliacrilamida?
Origen de la agarosa y la poliacrilamida:
Agarosa: La agarosa es un polímero de origen natural. Se deriva de las algas.
Poliacrilamida: La poliacrilamida es de origen sintético y no se encuentra bajo ninguna circunstancia natural.
Fórmula molecular de agarosa y poliacrilamida:
Agarosa: La fórmula molecular de la agarosa es C 24 H 38 O 19.
Poliacrilamida: La fórmula molecular de la poliacrilamida es (C 3 H 5 NO) n.
Estructura química de la agarosa y la poliacrilamida:
Agarosa: La agarosa es un polisacárido lineal. Está formado por unidades repetidas de disacáridos llamadas agrobiose que se mantienen juntas por enlaces de hidrógeno.
Poliacrilamida: La poliacrilamida es un polímero químicamente reticulado. Está compuesto por monómeros de acrilamida y un reticulante N, N'-metilenbisacrilamida.
Toxicidad de la agarosa y la poliacrilamida:
Agarosa: Tanto la agarosa como su unidad monomérica agrobiosa son de naturaleza no tóxica.
Poliacrilamida: la unidad monomérica de poliacrilamida, la acrilamida, es un presunto carcinógeno y neurotoxina conocida, mientras que su forma polimerizada no es tóxica por naturaleza.
Características de los geles de agarosa y poliacrilamida:
EDAD y PÁGINA:
Agarosa: la preparación de gel de agarosa para AGE requiere menos tiempo, es fácil y simple y no requiere un iniciador o catalizador de polimerización.
Poliacrilamida: La preparación de gel de poliacrilamida para PAGE requiere mucho tiempo y es tediosa y también requiere un iniciador (persulfato de amonio) y un catalizador de polimerización (N, N, N ', N'-tetrametiletilendiamina - TEMED).
Naturaleza:
Los geles de poliacrilamida son químicamente más estables que los geles de agarosa.
Tamaño de poro:
Dada la misma concentración, las matrices de gel de poliacrilamida tienden a tener tamaños de poro más pequeños en comparación con los de una matriz de gel de agarosa.
Modificación del tamaño de los poros:
El tamaño de los poros de los geles de poliacrilamida se puede alterar de una manera más controlada que el de los geles de agarosa.
Poder de resolución:
Los geles de poliacrilamida tienen un alto poder de resolución mientras que los geles de agarosa tienen un bajo poder de resolución.
Acomodación del ácido nucleico:
Los geles de poliacrilamida pueden acomodar mayores cantidades de ácido nucleico que los geles de agarosa para medios de resolución.
Imágenes cortesía: agarosa y estructura de poliacrilamida a través de Wikicommons (dominio público)
