La diferencia clave entre la HPLC de fase inversa y la fase normal es que la HPLC de fase inversa usa una fase estacionaria no polar y una fase móvil polar, mientras que la HPLC de fase normal usa una fase estacionaria polar y una fase móvil menos polar.
La HPLC de fase normal es la técnica más antigua de HPLC que Tswett utilizó en sus separaciones de extractos de plantas; usó tiza en una columna de vidrio. Este fue el modo clásico de cromatografía que llevó a nombrarlo como la técnica "normal". La HPLC de fase inversa, por otro lado, es lo opuesto a la técnica normal, que los científicos desarrollaron últimamente.