La diferencia clave entre el gen holandrico y el gen ligado al sexo es que el gen holandric es una forma de gen ligado al sexo ubicado en el cromosoma Y, mientras que el gen ligado al sexo es un gen ubicado en los cromosomas sexuales.
Un par de cromosomas sexuales puede decidir el sexo de los humanos y otros mamíferos. Los hombres tienen cromosomas XY, mientras que las mujeres tienen cromosomas XX. Los cromosomas X e Y no son homólogos. Tampoco tienen los mismos genes. El cromosoma Y es más corto y lleva una pequeña cantidad de genes en comparación con el cromosoma X. Los genes del cromosoma X se conocen como genes ligados al X. De manera similar, los genes ubicados en el cromosoma Y se conocen como genes ligados a Y o genes holandric. Tanto los genes ligados a X como los ligados a Y se conocen comúnmente como genes ligados al sexo.