La diferencia clave entre la transaldolasa y la transcetolasa es su función. La transaldolasa cataliza la conversión de sedoheptulosa 7-fosfato y gliceraldehídos 3-fosfato en eritrosa 4-fosfato y fructosa 6-fosfato, mientras que la transcetolasa cataliza la conversión de xilulosa 5-fosfato y ribosa 5-fosfato en gliceraldehído 3-fosfato y sedoheptulosa 7-fosfato.
La vía de las pentosas-fosfato es una vía metabólica que tiene lugar en paralelo a la glucólisis. Consiste en dos caminos distintos. En la ruta de las pentosas fosfato, el NADPH se genera en la fase oxidativa, mientras que los azúcares pentosa se generan en la fase no oxidativa. Además de pentosas y NADPH, esta vía genera ribosa 5-fosfato, que es un precursor de la síntesis de nucleótidos. La transaldolasa y la transcetolasa son dos enzimas involucradas en la fase no oxidativa de la vía de las pentosas fosfato.