La diferencia clave entre el efecto fundador y el efecto cuello de botella es que el efecto fundador se produce cuando un pequeño grupo de una población se separa de la población original y forma una nueva, mientras que el efecto de cuello de botella se produce cuando la población se contrae significativamente en un tamaño más pequeño debido a desastres naturales como terremotos, inundaciones e incendios.
La deriva genética es un fenómeno que es mucho más probable que ocurra en poblaciones pequeñas y menos probable que ocurra en poblaciones grandes. Básicamente, se produce debido a cambios aleatorios en las frecuencias de los alelos, lo que podría provocar la desaparición de algunos genes de poblaciones pequeñas. En última instancia, la deriva genética provoca una menor diversidad y variación genética en las poblaciones. también provoca la desaparición completa de algunas variantes genéticas de las poblaciones. Además, puede hacer que algunos alelos raros se vuelvan más frecuentes que antes e incluso que se fijen. Hay dos tipos de deriva genética como el efecto de cuello de botella y el efecto fundador. Causan reducciones extremas de la población.
