La diferencia clave entre gen y alelo es que el gen es una secuencia de nucleótidos específica que codifica una proteína específica, mientras que el alelo es una variante de un gen, ya sea la variante dominante o recesiva.
Un gen es la unidad básica de la herencia. Específicamente, tiene una secuencia de nucleótidos precisa que codifica una molécula de proteína específica, lo que le da un rasgo particular. Los genes pasan de padres a hijos. Por tanto, la información genética necesaria para el funcionamiento general del organismo se almacena en forma de genes. Además, un cromosoma tiene muchos genes. Por lo tanto, un gen en particular tiene una ubicación específica en el cromosoma, lo que llamamos locus. Por lo general, un gen tiene dos formas alternativas llamadas alelos. En palabras simples, los alelos son las variantes de los genes, ya sea la variante dominante o la variante recesiva. Están ubicadas al mismo nivel que las cromátidas hermanas del cromosoma.