La diferencia clave entre el alelo y el genotipo es que el alelo es una de las formas variantes de un gen ubicado en el mismo locus genético de un cromosoma, mientras que el genotipo es la constitución genética de un rasgo particular.
La genética es el estudio de genes y patrones hereditarios en organismos. Los cromosomas son las estructuras que contienen la información genética de un organismo. Por lo tanto, en eucariotas, hay un número específico de cromosomas presentes en el genoma. Cada cromosoma tiene miles de genes que son regiones específicas de los cromosomas. De hecho, los genes son unidades estructurales de la genética que almacenan información genética para producir proteínas. Cada gen tiene dos copias que descienden de cada padre.
De manera similar, un alelo es una variante de un gen o forma de un gen. Además, cada gen tiene dos formas de alelos que determinan la característica codificada por el gen. Por tanto, el genotipo es la composición genética de un organismo que está determinada por la distribución de alelos en diferentes genes.