La diferencia clave entre BLAST y FastA es que BLAST es una herramienta de alineación básica disponible en el sitio web del Centro Nacional de Información Biotecnológica, mientras que FastA es una herramienta de búsqueda de similitudes disponible en el sitio web del Instituto Europeo de Bioinformática.
BLAST y FastA son dos programas de software que se utilizan ampliamente para comparar secuencias biológicas de ADN, aminoácidos, proteínas y nucleótidos de diferentes especies y buscar sus similitudes. Estos algoritmos se escribieron teniendo en cuenta la velocidad. Porque, cuando los científicos pudieron aislar ADN en el laboratorio a mediados de la década de 1980, surgió la necesidad de comparar y encontrar genes idénticos para futuras investigaciones a alta velocidad. Por lo tanto, estos dos software se desarrollaron de manera que el usuario pueda realizar una búsqueda rápida de secuencias similares con la de sus secuencias de consulta.
BLAST es un acrónimo de Basic Local Alignment Search Tool y utiliza el enfoque localizado para comparar las dos secuencias. FastA es un software que se refiere a Fast A, donde A significa Todos. Aquí, el software funciona con alfabetos como Fast A para la secuenciación de ADN y Fast P para proteínas. Tanto BLAST como FastA comparan rápidamente cualquier base de datos del genoma y, por lo tanto, son muy viables tanto monetariamente como para ahorrar tiempo.
