La diferencia clave entre el gametofito masculino y femenino depende del tipo de célula que produce las dos estructuras. Las microsporas producen el gametofito masculino, mientras que las macrosporas producen el gametofito femenino.
Los gametofitos masculinos y femeninos surgen de heteroesporas. Dan lugar al ciclo de reproducción sexual en algas y plantas. Sin embargo, estos organismos también muestran alternancia de generaciones entre la generación esporofítica y la gametofítica. Los gametofitos masculinos y femeninos producen sus respectivos gametos masculinos y femeninos que son necesarios para la reproducción sexual. Cuando dos gametos se fusionan, se forma una célula diploide conocida como cigoto y continúa en la generación esporofítica.