La diferencia clave entre las mitocondrias y el cinetoplasto es que las mitocondrias son orgánulos de células eucariotas que producen energía (ATP). Mientras tanto, el cinetoplasto es una red de ADN circular presente dentro de una gran mitocondria, específicamente en protozoos de la clase Kinetoplastea.
Las células eucariotas tienen diferentes tipos de orgánulos celulares. Estos diferentes orgánulos llevan a cabo diferentes funciones dentro de la célula viva. De estos, las mitocondrias son uno de los orgánulos unidos a la membrana que se ven en una célula eucariota. Son los orgánulos responsables de la producción de energía (en forma de ATP) en las células. Por lo tanto, se consideran potencias de la célula. Las mitocondrias tienen su propio genoma, que es ADN circular heredado de la madre. El cinetoplasto es la red de ADN circular que se ve en la gran mitocondria de los organismos que pertenecen a la clase Kinetoplastida. Por tanto, los cinetoplastos sólo se ven en este subdominio eucariota.
