La diferencia clave entre la teoría de orbitales moleculares y la teoría de hibridación es que la teoría de orbitales moleculares describe la formación de orbitales de enlace y anti-enlace, mientras que la teoría de hibridación describe la formación de orbitales híbridos.
Existen diferentes teorías desarrolladas para determinar las estructuras electrónicas y orbitales de las moléculas. La teoría VSEPR, la teoría de Lewis, la teoría del enlace de valencia, la teoría de la hibridación y la teoría de los orbitales moleculares son teorías tan importantes. La teoría más aceptable entre ellas es la teoría de los orbitales moleculares.