La diferencia clave entre los orbitales híbridos y degenerados es que los orbitales híbridos son nuevos orbitales que se forman a partir de la mezcla de dos o más orbitales, mientras que los orbitales degenerados existen originalmente en un átomo.
Como su nombre lo indica, un orbital híbrido es un híbrido de dos o más orbitales. Aunque el nombre de orbital degenerado parece el mismo, no son orbitales recién formados, ya existen en un átomo. Además, todos los orbitales híbridos de una molécula tienen la misma energía, mientras que los orbitales degenerados de un átomo tienen la misma energía.