La diferencia clave entre parásitos y bacterias es que las bacterias son procariotas microscópicos unicelulares que viven por todas partes, mientras que los parásitos son los organismos que viven en o en sus huéspedes mientras causan infecciones a los huéspedes.
Los parásitos y las bacterias son organismos que se asemejan a organismos muy primitivos pero que tienen grandes adaptaciones para sobrevivir en diferentes condiciones ambientales. Para los humanos, estos organismos son primordiales porque la mayoría de las infecciones humanas son causadas por ellos. A veces, ciertas bacterias se consideran parásitos.