La diferencia clave entre las algas verdiazules y las algas verdes es que las algas verdiazules son organismos procarióticos que pertenecen al Reino Monera, mientras que las algas verdes son organismos eucarióticos que pertenecen al Reino Protista.
La fotosíntesis es el proceso que muestran los fotoautótrofos. Es el proceso que sintetiza los carbohidratos (alimentos) al capturar energía de la luz solar. El proceso requiere la presencia de pigmentos fotosintéticos, CO 2 y agua. Los fotoautótrofos poseen pigmentos fotosintéticos para realizar la fotosíntesis. Hay tres grupos principales de fotoautótrofos como plantas, cianobacterias (algas verdiazules) y algas (incluidas las algas verdes). Por lo tanto, tanto las algas verde azuladas como las algas verdes son organismos fotosintéticos. Sin embargo, las algas verdiazules son organismos procariotas, mientras que las algas verdes son organismos eucariotas. En consecuencia, existe una diferencia entre las algas verdiazules y las algas verdes en función de su organización celular y otras características.