La diferencia clave entre los antígenos endógenos y exógenos es que el antígeno endógeno se genera dentro de las células, mientras que el antígeno exógeno ingresa al cuerpo desde el exterior.
El antígeno es una molécula o sustancia que reacciona a un producto de una respuesta inmune específica y estimula la generación de anticuerpos. La antigenicidad de esa molécula particular es la capacidad de un antígeno para inducir la producción de anticuerpos. Además, los antígenos pueden ser una proteína o un polisacárido. Además, las células presentadoras de antígenos (APC), como las células dendríticas, median los procesos de captación de antígenos, procesamiento de antígenos y presentación de antígenos. Además, dependiendo de la actividad inmune, los antígenos pueden clasificarse como inmunógenos, tolerógenos o alérgenos. Además, también podemos clasificar los antígenos según su origen en exógenos o endógenos.