Diferencia clave: secuenciación de exoma frente a ARN
La secuenciación de ácidos nucleicos es la técnica que determina el orden de los nucleótidos en un fragmento particular de ADN o ARN de un organismo. La secuenciación es importante para identificar la composición de ADN y ARN de la célula y distinguir ciertos genes que codifican proteínas funcionales; por tanto, la secuenciación se puede utilizar para comprender las mutaciones de estos genes y las expresiones de estos. El método de secuenciación de Sanger o los métodos de secuenciación de próxima generación más avanzados son los métodos de secuenciación que se utilizan comúnmente. La secuenciación del exoma es la secuenciación del conjunto completo de exones o regiones codificantes de ADN presentes en un organismo, mientras que la secuenciación del ARN es el procedimiento de secuenciación de los ácidos ribonucleicos (ARN). Esta es la diferencia clave entre el exoma y la secuenciación de ARN …
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia clave
2. Qué es la secuenciación del exoma
3. Qué es la secuenciación del ARN
4. Similitudes entre la secuenciación del exoma y del ARN
5. Comparación lado a lado: secuenciación del exoma frente al ARN en forma tabular
6. Resumen
¿Qué es la secuenciación del exoma?
El exoma es un subconjunto del genoma que consiste en los genes codificadores de un organismo en particular. Los genes codificantes se denominan exones y se transcriben en ARNm y luego se traducen en secuencias de aminoácidos. Durante las modificaciones postranscripcionales, el mecanismo de empalme de ARN en eucariotas elimina los intrones (regiones no codificantes) y los exones permanecen. Hay dos técnicas principales en las que se realiza la secuenciación del exoma: basada en solución y basada en matriz.
En la secuenciación del exoma basada en solución, las muestras de ADN se fragmentan utilizando enzimas de restricción o un método mecánico y se desnaturalizan con calor. En esta técnica, se utilizan sondas de oligonucleótidos biotinilados (cebos) para hibridar selectivamente con regiones diana en el genoma. Se utilizan perlas de estreptavidina magnética para la etapa de unión. La unión va seguida de una etapa de lavado en la que se eliminan por lavado las secuencias no unidas y no dirigidas. Las dianas unidas luego se amplifican usando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y luego se secuencian usando secuenciación de Sanger o técnicas de secuenciación de próxima generación.
Figura 01: Secuenciación del exoma
El método basado en matrices también es similar al método basado en solución, excepto que los fragmentos de ADN se capturan en una micromatriz, y luego siguen los pasos de unión y lavado antes de secuenciarlos.
La secuenciación del exoma se utiliza en muchas aplicaciones, como el diagnóstico genético de enfermedades, en la terapia génica, en la identificación de nuevos marcadores genéticos, en la agricultura para identificar diversos rasgos agronómicos beneficiosos y en los procedimientos de mejoramiento vegetal.
¿Qué es la secuenciación de ARN?
La secuenciación del ARN se basa en el transcriptoma, que son las transcripciones completas de la célula. Los objetivos clave de la secuenciación de ARN son catalogar todas las especies de la transcripción, incluido el ARNm, el ARN no codificante y el ARN pequeño, para determinar la estructura transcripcional de los genes y cuantificar los niveles de expresión de cada transcripción durante el desarrollo. Durante la secuenciación de ARN, las tecnologías de hibridación (que eran ADN complementario derivado de secuencias de ARNm maduras) se utilizaron inicialmente para la secuenciación. En la actualidad, se utiliza una técnica de rendimiento más precisa y avanzada para la secuenciación de ARN.
Figura 02: Secuenciación de ARN
En la secuenciación de ARN, una muestra de ARN que puede ser ARN total o ARN fraccionado se convierte en su ADN complementario (ADNc) mediante transcripción inversa, y se prepara una biblioteca de ADNc. Cada fragmento de ADNc se une a adaptadores en ambos lados (secuenciación de extremos de pares) o en un lado (secuenciación de extremos únicos). Estas secuencias etiquetadas se secuencian usando secuenciación de Sanger o la próxima generación, como secuenciación del exoma.
¿Cuáles son las similitudes entre el exoma y la secuenciación de ARN?
- Se pueden usar fragmentos cortos seleccionados o todo el conjunto de ADN / ARN para la secuenciación de Exoma o ARN.
- Los fragmentos secuenciados se conservan en bibliotecas.
- Se puede utilizar la secuenciación de Sanger o la secuenciación de próxima generación.
- Ambos son métodos de secuenciación in vitro.
- Los fragmentos secuenciados se pueden determinar mediante etiquetas fluorescentes.
¿Cuál es la diferencia entre el exoma y la secuenciación de ARN?
Diferencia del medio del artículo antes de la mesa
Secuenciación de exoma vs ARN |
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| La secuenciación del exoma es la secuenciación del conjunto completo de exones o regiones codificantes de ADN presentes en un organismo. | La secuenciación de ARN se refiere al procedimiento de secuenciación de ácidos ribonucleicos (ARN); el transcriptoma. |
| Muestra inicial | |
| El ADN genómico es la muestra inicial de la secuenciación del exoma. | El ARN es la muestra inicial de la secuenciación del ARN. |
| Composición | |
| Contiene solo regiones codificantes del ADN total conocidas como exones | Este contiene ARN-ARNm / transcriptoma. |
| Secuenciación | |
| Hay dos métodos principales de secuenciación del exoma; tecnologías basadas en soluciones y basadas en matrices. | La secuenciación de ARN se realiza mediante la preparación de una biblioteca de ADNc extrayendo el ARN total o ARN fragmentado. |
Resumen - Secuenciación de exoma vs ARN
El exoma es el conjunto completo de regiones codificantes de un organismo y las técnicas involucradas en la determinación del orden exacto de los nucleótidos del exoma se conocen como secuenciación del exoma. La secuenciación de ARN es la técnica involucrada en la determinación del orden de nucleótidos del ARN de un organismo. Esta es la diferencia entre el exoma y la secuenciación de ARN …
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