La diferencia clave entre micoplasma y clamidia es que el micoplasma es un género de bacterias que carece de pared celular, mientras que la clamidia es un género de bacterias que incluye parásitos gramnegativos y obligados.
Las especies de Mycoplasma son las bacterias más pequeñas que se han descubierto hasta ahora, con los genomas más pequeños y un número mínimo de orgánulos muy esenciales. El micoplasma es una bacteria sin paredes. Por tanto, no tienen una forma definida. Generalmente, son células de forma esférica a filamentosa. Por el contrario, la clamidia es un género de bacterias que tiene paredes celulares. Son bacterias gramnegativas. Tanto el micoplasma como la clamidia causan enfermedades de transmisión sexual. Además, producen síntomas similares, pero pueden tratarse con diferentes antibióticos.