La diferencia clave entre éster y éter es que el grupo funcional de un éster es –COO, mientras que el grupo funcional de un éter es –O-.
El éster y el éter son moléculas orgánicas con átomos de oxígeno. Los ésteres tienen el grupo –COO. Aquí, un átomo de oxígeno está unido al carbono con un doble enlace y el otro oxígeno está unido con un enlace simple. Dado que solo tres átomos se conectan con el átomo de carbono, tiene una geometría plana trigonal a su alrededor. Además, el átomo de carbono tiene hibridación sp 2. Además, un éster es un derivado de ácido carboxílico. Un éter, por otro lado, tiene un átomo de oxígeno con dos enlaces simples con dos grupos alquilo o arilo. El átomo de oxígeno también tiene dos pares de electrones solitarios.