Diferencia clave: sonda vs cebador
La sonda molecular es un pequeño fragmento de ADN o ARN que reconoce las secuencias complementarias en el ADN o ARN y permite la identificación de la secuencia diana. El cebador es un pequeño tramo de ADN o ARN que sirve como punto de partida para la síntesis de ADN. Los cebadores y las sondas se hibridan con los nucleótidos complementarios del ADN molde o el ADN diana. Sin embargo, la diferencia clave entre sonda y cebador es que los cebadores son necesarios para la replicación del ADN, mientras que las sondas son necesarias para la detección de secuencias específicas en el ADN de la muestra.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia clave
2. Qué es Probe
3. Qué es Primer
4. Comparación lado a lado: Probe vs Primer
5. Resumen
¿Qué es una sonda?
La sonda es un pequeño fragmento de ADN o ARN que se utiliza para detectar el ADN o ARN diana en la muestra mediante hibridación molecular. También se conocen como marcadores moleculares. La longitud de la sonda puede variar (de 100 a 1000 bases) y los nucleótidos de la sonda son complementarios a la parte de la secuencia diana. Para facilitar la detección, las sondas se marcan con isótopos radiactivos o con tintes fluorescentes o anticuerpos. Las sondas se unen a las bases complementarias de la secuencia diana y revelan la presencia del ADN o ARN diana en la muestra. Hay dos métodos principales de etiquetado de sondas: etiquetado final y traducción de muescas. Las sondas se clasifican en diferentes tipos, incluidas sondas de ADN, sondas de ARN, sondas de ADNc y sondas de oligonucleótidos sintéticos, y se preparan utilizando diferentes técnicas.
Las sondas son herramientas importantes en muchas áreas microbianas y moleculares como virología, patología forense, pruebas de paternidad, huellas de ADN, detección de enfermedades genéticas, RFLP, citogenética molecular, hibridación in situ, etc.
Figura 01: Sonda marcada con fluorescencia utilizada en FISH para la detección de patógenos
¿Qué es una cartilla?
El cebador es un fragmento corto de ADN o ARN que sirve como iniciador para la síntesis de ADN. La enzima ADN polimerasa agrega nucleótidos al grupo 3 'OH de la secuencia del cebador y sintetiza la nueva hebra complementaria al ADN molde. Los cebadores son fragmentos muy cortos con una longitud de 18 a 20 nucleótidos. Se sintetizan químicamente en el laboratorio para la amplificación de ADN in vitro (PCR). Los cebadores pueden tener cualquier secuencia de nucleótidos ya que están diseñados por el usuario. Se sintetizan para coincidir con las bases complementarias del ADN molde. Por tanto, puede tener cualquier secuencia de nucleótidos. Los cebadores son de suma importancia para la replicación del ADN, ya que la ADN polimerasa no puede sintetizar ADN nuevo sin un fragmento de ADN preexistente. Al diseñar los cebadores para PCR, se deben considerar las siguientes cosas:
- Los cebadores deben contener los nucleótidos complementarios del extremo flanqueante del ADN que desea amplificar.
- Las imprimaciones deben tener una temperatura de fusión entre 55 y 65 0 C
- El contenido de G y C debe estar entre el 50 y el 60%.
En la PCR se utilizan dos cebadores como directo e inverso para replicar ambas cadenas del ADN de la muestra. Los cebadores se utilizan comúnmente para realizar la secuenciación de ADN y PCR.
Figura 02: Recocido de cebadores en PCR
¿Cuál es la diferencia entre Probe y Primer?
Diferencia del medio del artículo antes de la mesa
Sonda vs Primer |
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| La sonda es un pequeño fragmento de ADN / ARN que se utiliza para detectar la presencia de la secuencia diana en una muestra mediante hibridación molecular. | El cebador es un pequeño tramo de ADN o ARN que sirve como punto de partida para la replicación del ADN. |
| Función | |
| Esto detecta la presencia de una secuencia específica en la muestra de ADN o ARN. | Esto actúa como punto de partida para la síntesis de ADN. |
| Longitud | |
| La longitud puede estar en el rango de 100 a 1000 bases. | La longitud es generalmente de 18 a 20 bases. |
| Encuadernación con secuencia complementaria | |
| La sonda se hibrida con las bases complementarias de la secuencia diana | El cebador se hibrida con las bases complementarias de las cadenas de ADN. |
| Etiquetado | |
| Las sondas están etiquetadas para facilitar la detección | Los cebadores generalmente no están etiquetados |
| Uso en PCR | |
| Las sondas no se utilizan en PCR | Los cebadores se utilizan en PCR |
Resumen - Sonda vs Primer
La sonda es un pequeño fragmento de secuencia de ADN o ARN que se puede hibridar con nucleótidos complementarios para detectar una secuencia diana en la muestra. Las sondas se marcan de forma radiactiva, inmunológica o fluorescente para ver la presencia de la secuencia diana. El cebador es un fragmento de ADN o ARN muy pequeño que actúa como punto de partida para la amplificación del ADN in vitro. La ADN polimerasa identifica el cebador del grupo 3 'OH e inicia la construcción de una nueva hebra complementaria a la plantilla. Las sondas y los cebadores funcionan de manera similar al hibridar con nucleótidos complementarios. Por lo tanto, la diferencia clave entre sonda y cebador es su función principal.
