La diferencia clave entre el endogrupo y el exogrupo en biología es que un endogrupo es un grupo de taxones estrechamente relacionados que se investigan en busca de relaciones evolutivas, mientras que el grupo externo es un grupo de referencia o un taxón fuera del grupo de interés y relacionado más lejanamente con el grupo interno.
La cladística o filogenética es el método más utilizado en la clasificación biológica. Utiliza el antepasado común más reciente para clasificar los organismos en grupos o clados. El análisis cladístico finalmente produce un cladograma, que es un diagrama en forma de árbol que representa las relaciones filogenéticas entre organismos. Por tanto, la cladística ayuda a determinar las relaciones evolutivas entre especies, especialmente organismos monofiléticos. El grupo externo y el grupo interno son dos grupos definidos en cladística. El endogrupo es el grupo de taxones que se investiga para determinar las relaciones evolutivas. Son taxones estrechamente relacionados o taxones hermanos. Por el contrario, un grupo externo es un grupo de referencia que está fuera del grupo de interés. El grupo externo está relacionado lejanamente con el grupo interno.
