La diferencia clave entre la mutación de la línea germinal y la mutación somática es que la mutación de la línea germinal se hereda de la descendencia, mientras que la mutación somática no es inherente a la descendencia.
El ADN es el material hereditario de la mayoría de los organismos vivos. La mutación es una alteración permanente de la secuencia de nucleótidos de un fragmento de ADN o un gen. En los organismos vivos ocurren diferentes tipos de mutaciones. Entre ellos, las mutaciones somáticas y las mutaciones de la línea germinal son dos tipos principales. Las mutaciones somáticas ocurren en células de un solo cuerpo, mientras que las mutaciones de la línea germinal ocurren en gametos. Cuando la mutación somática tiene lugar en una sola célula del cuerpo, afecta solo al tejido que se deriva de la célula mutada. En contraste con eso, todas las células del cuerpo afectan cuando ocurre la mutación de la línea germinal. La principal diferencia entre la mutación de la línea germinal y la mutación somática es la posibilidad de que estas mutaciones pasen a la descendencia o no.