Diferencia clave: ligadura de extremos romos y adhesivos
Las endonucleasas de restricción son enzimas específicas que cortan el ADN bicatenario (dsDNA). También se las conoce como tijeras moleculares en biología molecular. Las enzimas de restricción son capaces de reconocer secuencias cortas específicas del dsDNA conocidas como sitios de reconocimiento y escindir enlaces fosfodiéster e hidrógeno para abrir cadenas dobles. Como resultado de la escisión por estas enzimas, los fragmentos de ADN se producen con diferentes tipos de extremos, como extremos pegajosos y extremos romos. La ADN ligasa es una enzima utilizada en biología molecular para unir dos hebras adyacentes de ADN formando nuevos enlaces. El paso se conoce como ligadura y, según el tipo de extremo de ADN ligado, pueden denominarse ligadura de extremos romos y ligadura de extremos pegajosos. La diferencia clave entre la ligadura de extremos romos y pegajosos es que la ligadura de extremos romos ocurre entre fragmentos de ADN que contienen dos extremos romos, mientras que la ligadura de extremos pegajosos ocurre entre salientes 5 'y 3'. En comparación con la ligadura de extremos romos, la ligadura de extremos pegajosos es más eficiente y estable.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es la ligadura de extremos romos?
3. ¿Qué es la ligadura de extremos pegajosos?
4. Comparación lado a lado: ligadura de extremos romos y pegajosos
5. Resumen
¿Qué es una ligadura de extremos romos?
Algunas endonucleasas de restricción pueden cortar el ADN en las bases opuestas y producir fragmentos de ADN de extremos romos. Estas enzimas se conocen como cortadores de extremos romos; se escinden directamente hasta la mitad del sitio de restricción sin dejar bases colgantes monocatenarias. Los extremos romos también se conocen como extremos que no sobresalen ya que no tienen bases sobresalientes de 3 'y 5' en los extremos. Ambas hebras terminan de pares de bases en extremos romos. Las enzimas comunes de corte de extremos romos son EcoRV HaeIII, AluI y SmaI.
La ligadura de extremos romos está involucrada entre dos extremos romos. No es una ligadura de bases salientes. Esta ligadura es menos eficaz que la ligadura de puntas pegajosas. Sin embargo, en algunas ocasiones, la ligadura de extremos romos se vuelve más ventajosa que la ligadura de extremos pegajosos, especialmente cuando se ligan productos de PCR. Los productos de PCR siempre se producen con extremos romos. La ligadura de extremos romos no requiere extremos complementarios en el ADN para la ligadura.
Figura 01: Producción de extremos romos por la enzima Eco RV
¿Qué es una ligadura de puntas pegajosas?
Algunas endonucleasas de restricción son capaces de cortar el dsDNA, dejando un trozo de ADN monocatenario que sobresale al final. Estos extremos se conocen como extremos pegajosos o colgantes. La ligadura de los extremos pegajosos se produce entre dos fragmentos de ADN que contienen proyecciones coincidentes porque los extremos pegajosos tienen bases no apareadas y requieren bases complementarias para formar enlaces. Por tanto, es necesario utilizar la misma enzima de restricción para ambas fuentes de ADN para producir los fragmentos de ligadura correspondientes.
La ligadura de extremos pegajosos es más eficaz y, a menudo, es muy deseable en los procesos de clonación. Hay varias enzimas de restricción que producen puntas pegajosas. Son EcoRI, BamHI, HindIII, etc.
Figura 02: Producción de extremos pegajosos por la enzima Eco RI
¿Cuál es la diferencia entre la ligadura de extremos romos y pegajosos?
Diferencia del medio del artículo antes de la mesa
Ligadura de extremos romos vs pegajosos |
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| La ligadura de extremos romos se produce entre dos fragmentos de ADN de extremos romos. | La ligadura de extremos pegajosos se produce entre dos fragmentos de ADN coincidentes con extremos pegajosos. |
| Enzimas | |
| Los cortadores de extremos romos producen extremos romos. | Los cortadores de extremos pegajosos producen extremos pegajosos o cohesivos. |
| Requisito de extremos coincidentes | |
| No requiere fragmentos coincidentes ni bases complementarias. | Requiere bases complementarias en los extremos para formar pares de bases. |
| Eficiencia | |
| Es menos eficiente que la ligadura de puntas pegajosas | Es más eficaz que la ligadura de extremos romos. |
Resumen: ligadura de extremos romos vs pegajosos
Las endonucleasas de restricción pueden escindir el dsDNA y producir fragmentos de DNA con diferentes extremos. Reconocen secuencias específicas y restringen el ADN creando extremos pegajosos y romos. Los extremos pegajosos tienen bases no emparejadas al final de los fragmentos. Los extremos romos se crean debido a un escote recto y tienen pares de bases en los extremos. La ligadura de extremos pegajosos requiere dos piezas complementarias de ADN monocatenario. La ligadura de extremos romos ocurre entre dos fragmentos de extremos romos cualesquiera. Esta es la diferencia entre ligadura roma y pegajosa.
