La diferencia clave entre la proteína quinasa A y la proteína quinasa C es que la proteína quinasa A es un tipo de proteína quinasa que depende del AMP cíclico, mientras que la proteína quinasa C es una subfamilia de proteínas quinasas que responde a la señalización de lípidos.
La quinasa es una enzima que cataliza la transferencia del grupo fosfato de moléculas donantes de fosfato de alta energía a sustratos específicos. A este proceso lo llamamos fosforilación. Las quinasas regulan la mayoría de las vías celulares, incluida la transducción de señales. Las proteínas quinasas son un tipo específico de quinasas que catalizan la fosforilación de proteínas o transfieren fosfato a proteínas sustrato precisas. Estas enzimas regulan la actividad biológica de las proteínas mediante la fosforilación de aminoácidos específicos con grupos fosfato del ATP. Una vez que ocurre la fosforilación, las proteínas inactivas se transforman en proteínas activas debido al cambio conformacional. La proteína quinasa C y la proteína quinasa A son dos tipos de familias de proteína quinasa que pertenecen a la subfamilia: AGC quinasa de proteína quinasas.