La diferencia clave entre la inmunofluorescencia directa e indirecta es que la inmunofluorescencia directa utiliza un solo anticuerpo que actúa contra el objetivo de interés, mientras que la inmunofluorescencia indirecta utiliza dos anticuerpos para marcar el objetivo de interés.
La inmunofluorescencia o imagenología celular es una técnica que se utiliza para marcar un antígeno diana específico con un fluoróforo. Aquí, el fluoróforo es un compuesto químico fluorescente que puede volver a emitir luz tras la excitación de la luz. Cuando un fluoróforo se une al antígeno diana, permite la detección de la molécula diana en la muestra. Para describirlo con más detalle, cuando un antígeno se une a un anticuerpo específico, puede conjugarse con fluoróforos. Por tanto, es fácil detectar la presencia del antígeno diana en la muestra cuando se observa bajo el microscopio de fluorescencia.
Además, existen dos tipos de inmunofluorescencia; inmunofluorescencia directa e indirecta. La diferencia entre la inmunofluorescencia directa e indirecta radica principalmente en el número de anticuerpos utilizados y la conjugación del fluoróforo. Es decir, en inmunofluorescencia directa, el fluoróforo se conjuga directamente con el anticuerpo primario mientras que en inmunofluorescencia indirecta, el fluoróforo se conjuga con el anticuerpo secundario.