La diferencia clave entre la genética clásica y la moderna es que la genética clásica es la genética mendeliana o el concepto más antiguo de genética, que se expresa únicamente en función de los fenotipos resultantes de experimentos de reproducción, mientras que la genética moderna es el nuevo concepto de genética, que permite la investigación de genotipos junto con fenotipos.
El gran científico Gregor Mendel es el padre de la genética. Mendel introdujo varias leyes con respecto a la herencia de rasgos y cómo los rasgos pasan de padres a hijos. Por lo tanto, sus hallazgos se convirtieron en la base del concepto completamente nuevo descubierto más tarde en genética. Por tanto, la genética clásica y la genética moderna son dos conceptos distintos. Sin embargo, la genética clásica es la base de la genética moderna.