La diferencia clave entre las coliformes y las enterobacterias es que las coliformes son un grupo de bacterias gram negativas, en forma de varilla y que fermentan la lactosa, mientras que las enterobacterias son una gran familia de bacterias gram negativas.
Los organismos indicadores son los organismos que tienen el uso como signos para indicar una situación particular. Indican la presencia de algo que no es normal. Los coliformes y las enterobacterias son bacterias indicadoras que indican el signo de la calidad sanitaria de los alimentos y el agua y también indican las condiciones del medio ambiente. Además, todos los coliformes pertenecen a Enterobacteriaceae, pero todos los miembros de Enterobacteriaceae no son coliformes.