La diferencia clave entre la secuencia conservada y la secuencia de consenso es que la secuencia conservada se refiere a secuencias similares de ácidos nucleicos o aminoácidos que ocurren en especies diferentes o iguales a lo largo de generaciones, mientras que la secuencia consenso es una secuencia de nucleótidos o secuencia de aminoácidos que se encuentra comúnmente en una región altamente conservada. de ADN o ARN o proteína.
Los organismos comparten características similares y diferentes. Al estudiar las relaciones entre organismos y clasificarlos, el genoma o la composición genética de los organismos es muy importante. Hay algunas secuencias de nucleótidos o aminoácidos que son comunes entre diferentes organismos. Una secuencia conservada es una secuencia de aminoácidos o ácidos nucleicos que es coherente entre las especies. Por tanto, son filogenéticamente importantes a la hora de generar árboles filogenéticos. En las secuencias conservadas, hay secuencias de nucleótidos específicas que se encuentran más comúnmente. Se conocen como secuencias de consenso.